برخی از نرم‌افزارها نیز برای کمک به سیستم سازی کاربردی کسب و کار طراحی شده‌اند که برخی از مهم‌ترین آن‌ها عبارتند از:

• برنامه‌های مدیریت پروژه شامل طیف گسترده‌ای از ویژگی‌ها هستند که گردش کار را ساده می‌کند. مانند چک لیست‌ها، تابلوهای کانبان، تقویم‌ها و موارد دیگر.
• برنامه‌های مدیریت وظیفه بر روی یک سری وظایف خطی تمرکز می‌کنند و آنها را برای فرآیندهای تجاری که بسیار قابل تکرار هستند مفید می‌کند.
• پلتفرم‌های منابع انسانی نمونه‌ای از برنامه‌های تخصصی هستند که می‌توانند برای سیستم‌بندی گردش‌های کاری خاص منابع انسانی استفاده شوند. مانند استخدام، حقوق و دستمزد، حضور و غیاب و غیره.
• صفحات گسترده ممکن است به اندازه انواع دیگر ابزارهای فهرست شده در اینجا ویژگی‌های زیادی نداشته باشند. اما به راحتی می توان از آنها برای ایجاد چک لیست و الگو استفاده کرد.
• پلتفرم های templates CRM نیز ابزار تخصصی دیگری هستند که فرآیندهای فروش و بازاریابی را سیستماتیک می‌کنند.

نرم افزارهای بسیاری وجود دارند که می توان از آن‌ها برای ساده کردن گردش کار استفاده کرد. در برخی موارد، بهتر است از یک ابزار عمومی مانند برنامه مدیریت وظایف استفاده کنید. در موارد دیگر، بهتر است از یک ابزار تخصصی مانند پلتفرم منابع انسانی یا پلتفرم CRM استفاده کنید. یا در موارد دیگر، استفاده از چندین ابزار به طور همزمان ایده خوبی است. به عنوان مثال، یک سند مرجع یا یک گردش کار در یک برنامه مدیریت کار ممکن است به چندین چک لیست یا الگو پیوند دهد. اگرچه این ممکن است کمی پیچیده به نظر برسد، اما مزایای سیستم سازی بسیار بیشتر از این پیچیدگی است. در واقع، هر چه فرآیند پیچیده‌تر باشد، نظام مند کردن آن ضروری تر و مفیدتر است. فرآیندهای پیچیده، به هر حال، بیشتر مستعد خطاها و نادیده‌انگاری‌ها هستند. بنابراین ایجاد دستورالعمل‌ها و فرآیندهای گام به گام برای پیروی از آن ضروری‌تر است.